在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外，还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际，他们决定要攻进帕拉迪岛，把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……。

　　冈田猛男（江口拓也 配音）是集英高中一年级的学生，隶属于柔道部，他生得人高马大五大三粗，却因为善良率真的个性而深得同伴们的喜爱和信赖。砂川诚（岛崎信长 配音）是猛男青梅竹马的好友，外表英俊帅气的他很受女孩子的欢迎，从小到大，凡是猛男喜欢上的女孩，最后总会被阿诚吸引，久而久之，猛男竟然也习以为常。

　　2012年2月，东京铁塔上空出现了巨大的数码蛋。就在本宫大辅（20岁）和V仔兽修行拉面技艺的时候，遇到了虽然拿着有裂纹的数码器，但身边没有搭档数码兽的迷之青年——自称“我没有数码兽，我的搭档数码兽被我杀了，我是世界上最初和数码兽建立搭档关系的人类。”